本发明提供了基于IEC61850通信协议的电能质量监测系统，包括web模块、通讯模块和校验模块，其中所述web模块用于向所述通讯模块下发页面请求命令和定时取数据任务、接收并以图形图表等方式展示来自通讯模块的电能质量数据；所述通讯模块基于IEC61850通信协议，用于连接电能质量监测设备、传输电能质量监测系统所需的统计数据和实时数据、配置电能质量监测设备的配置信息；所述校验模块用于检测并配置电能质量监测设备。本发明可以将不同生产商的电能质量监测设备纳入到电能质量监测系统，实现设备的多样性和提高电能质量监测系统的适应性。基于IEC61850通信协议的通讯模块解决了实时通道的数据传输问题，还能传输统计数据的PQDIF数据格式文件，实现对海量数据的全面控制。