本发明涉及船舶自动识别系统移动基站数据传输方法，其可使具有AIS终端的船舶可通过AIS信号接口获取该船舶的AIS设备的AIS信息，并利用北斗卫星通讯系统将AIS信息传输给AIS服务器，由AIS服务器接收后进行统一处理，这样，具有AIS终端的船舶就相当于海上的AIS移动基站。采用北斗卫星通讯系统作为通讯方式，最大的效果在于其通讯及时性和高频率，还具有总成本较低的优点，而且，本发明还可以避免多台AIS移动基站收到同一条船舶的AIS信息后重复上传的问题，从而避免了大量冗余数据的上传，增强了北斗卫星通讯系统带宽的有效利用。