本发明涉及一种基于双飞行机器人对辐射源目标的定位方法及系统。本方法是采用两架无人飞行机器人机载主控系统，通过采集目标信号，对信号的方向进行测量，并将测向结果通过无线通讯进行两无人飞行器间的通讯，利用三角定位方法进行目标定位，并进行修正，修正航向，重复不断对目标进行定位，同时进行逼近飞行，从而实现对目标精确定位。本系统是在两无人飞行机器人上安装GPS定位仪、无线电通讯设备、飞行控制设备、主控单元和信号测向仪，基地上安装总控单元、无线通讯设备及天线，在两无人飞行机器人之间及与基地间实现无线通讯。本发明能迅速且精确搜寻并定位辐射源目标。