一种远端周边的控制系统、方法及其远端服务器，应用在远端服务器与远端的周边设备进行操作。周边的控制方法包括：于远端服务器中生成多台虚拟机器；虚拟机器上产生虚拟通讯端口；客户端连线至远端服务器时，远端服务器选择虚拟机器，客户端连结于所选的虚拟机器；虚拟机器将虚拟通讯端口与客户端的目标通讯端口进行映射，虚拟机器透过虚拟通讯端口将操作指令传送至目标通讯端口；客户端中断连线时，虚拟机器将操作指令暂存于缓存空间中；客户端再连接于虚拟机器，虚拟机器将暂存于缓存空间的操作指令透过虚拟通讯端口映射至所对应的目标通讯端口与周边设备。