本发明公开一种IEC104通讯规约转发中实现数据交换的方法及系统，该方法为：1.创建接收管理线程、发送管理线程及接收队列和发送队列；2.接收终端和/或主站所发送的报文；3.根据接收者IP地址判定该报文来自终端还是主站，且标识终端和主站的类型及ID号；4.根据报文的控制域字节判断报文是否为该通讯规约的I帧，若是，则转5，若否，则返回2；5.读取并解析I帧报文，并对其帧序号匹配；6.将匹配后的I帧报文存储在发送队列；7.读取I帧报文，并将其发送至携带标识的终端或主站。通过子站将接收的I帧报文转发至终端或主站，并对其帧序号匹配，解决该通讯规约帧序号不匹配及子站与多个终端使用该通讯规约通信阻塞的问题。