本发明涉及一种用于富集土著微生物净水的营养型填料及其制备方法，属于水产养殖技术领域。其主要取市售的自养和异养微生物的生长营养物质，分别与多孔物质、载体和粘附物质按重量比例充分混合，置于直径3cm的球型模具中，经100℃烘烤后用无纺布包被，按比例经包装机包装封口，每个包装净含量为500个。本发明可直接投入养殖水体，通过缓释营养成分，选择性地培养、富集和附着不同生理特性的微生物，形成固定化的生物菌膜，在不添加外源性微生物制剂的情况下有效降解养殖环境中的蛋白质、碳水化合物等有机物质，去除水质和底质中的氮磷等植物性营养元素，优化和修复养殖环境，为水产养殖生物营造一个良好的生态环境。