本发明涉及环境工程和生态工程领域。三峡库区山坡地沟壑农业面源污染生态谷坊阻控系统，其特征在于：它由多级生态谷坊依山坡地呈从高至低的自然落差的梯形状分布；每一级生态谷坊由蓄水调节池、人工湿地和谷坊坝主体组成，三者按水流方向依次布置；蓄水调节池与上一级的谷坊坝主体上的溢流口相通。本发明可对流域山坡地沟壑农业面源污染进行有效拦截和控制，减少水土流失，集雨灌溉，降低坡地降雨前后沟道养分衰减，实现农业面源污染物生态拦截。