本发明公开了一种间歇共基质调控共代谢分解难降解酚类污染物的方法，具体是向含有酚类污染物的水体中以浓度递减的方式间歇式投加共基质溶液，首次投加的共基质溶液中共基质的质量与含有酚类污染物的水体中酚类污染物的质量之比为10-500:1，投加共基质溶液的间隔时间为1-7天，第二次投加的共基质溶液质量为首次投加的共基质溶液质量的1/10～9/10，第三次投加的共基质溶液质量为第二次投加的共基质溶液质量的1/10～9/10，以此类推，直至含有酚类污染物的水体中酚类污染物的浓度降低至允许范围。本发明具有操作灵活、适应范围广、运行成本低、处理效果好、应用前景大的优点。