本发明公开了一种换流阀内冷却水净化处理方法及装置，其方法是：1、在由依次连接的换流阀、换热器和循环泵组成的换流阀内冷却水净化处理装置主循环回路上加装第一精密过滤器和主循环回路电导率表，在主循环回路的循环泵进出口上设置由电除盐器、第二精密过滤器和旁路电导率表组成的旁路；2、调节电除盐器进口冷却水的流量，根据旁路电导率表控制该电除盐器出口的电导率；3、当所述主循环回路电导率表所显示的电导率值超过0.5μS/cm，采用更换换流阀内冷却水或者排除所述电除盐器内污垢两种措施之一，直至主循环回路电导率表所显示的电导率值回归至0.1～0.5μS/cm范围。本发明能够精确控制内冷却水水质，同时有效避免杂质堵塞；可以实现完全自动化，操作安全简单。