本发明涉及一种控制养殖水体蓝藻过度繁殖的生物制剂及制备方法，属于水产养殖技术领域。其主要取市售高活性的溶菌酶、多功能微生物菌株、赖氨酸和载体，将上述组分按比例称重，然后在20℃下混合均匀后经自动包装机包装封口，每个包装净含量为250~500g。本发明可直接投入养殖水体，快速降解养殖环境中的蛋白质等大分子有机物质，去除水质和底质环境中的氮磷等植物性营养元素，抑制蓝藻的过度生长繁殖，加速蓝藻细胞的衰亡，降低水体中叶绿素的含量，降低藻类密度，提高透明度，快速修复养殖水体环境的富营养化，为水产养殖生物营造一个良好的水体环境。