本发明涉及一种污泥深度脱水的方法与系统，其方法包括以下步骤：S1、将污泥与改性剂加入到污泥调质罐内；S2、在污泥调质罐中充分搅拌污泥和改性剂，污泥发生絮凝改性；S3、对从污泥调质罐中流出的污泥进行二级过滤，然后通过高压泵输送至高压隔膜板框压滤机进行压滤，挤出污泥中的水分，形成泥饼；S4、将泥饼通过螺旋输送设备送至泥饼卸料仓存储；其系统包括改性剂储料仓（1）、改性剂输送装置（2）、污泥调质罐（3）、二级过滤装置（4）、高压泵（5）、高压隔膜板框压滤机（6）、螺旋输送设备（8）和泥饼卸料仓（9）。本发明自动化程度高，提高了污泥处理效率，并且污泥在封闭的设备中传输，不会对环境产生二次污染。