本发明提供一种反渗透/纳滤系统复合阻垢剂，该阻垢剂由以下方法制成：组分1：环糊精溶液，重量百分含量2～10％；组分2：氨基三甲叉膦酸ATMP，马来酸酐-丙烯酸共聚物MA-AA，2-膦酸丁烷-1，2，4-三羧酸PBTCA，羟基乙叉二膦酸HEDP中至少一种或几种混合物，总重量百分含量80～90％；组分3：2，2-二溴-3-氰基丙酰胺DBNPA，重量百分含量1％～10％；组分2和组分3混合，再和组分1融合在一起。将该阻垢剂加入反渗透、纳滤、超滤系统，可以有效的减轻碳酸钙盐、硫酸钙盐、硫酸钡、硫酸锶、氟化钙、铁胶体以及硅胶体对反渗透、纳滤、超滤系统造成的污染，同时减轻生物污染，提高系统的工作效率，延长反渗透、纳滤、超滤系统的清洗周期及运行寿命，降低反渗透的成本。