本发明创新性的利用潮汐式生物反应器来快速繁殖百合移栽小籽球，通过将常规固体繁殖培养基中培养生长到直径0.2～0.4cm百合小籽球作为外植体接入到潮汐式生物反应器中，在50天的培养过程中替换液体培养基配方，并通过添加药品控制污染，逐步进行籽球膨大与生根，籽球出瓶后，按照常规百合籽球春化、移栽、种植方法进行管理。本发明通过逐步进行籽球膨大和生根培养，可简化组培程序，极大的减少常规固体组织培养中的人工成本，并可有效控制污染与变异株的产生，缩短了百合繁育周期，节约了生产成本，能将百合新品种的优良性状快速固定并保持下来，解决了常规百合繁育体系生产的籽球繁育速度慢，种源混杂，籽球质量不稳定的难题。