一种膜处理装置及膜组件的运转方法，能够尽可能地使各膜元件内部的污染程度均等。该膜处理装置具有：内置在容器(5)内的多个膜元件(3，4)、原水供给部(6)、一侧的透过水回收部(7)、另一侧的透过水回收部(8)和浓缩水排出部(9)，还具有能够改变流经透过水回收部(7，8)的透过水流量的流量调节阀(28，33)、测定通过透过水回收部(7，8)回收的透过水的电导率的电导率仪(30，35)、测定通过透过水回收部(7，8)回收的透过水流量的流量仪(31，36)。