本发明涉及一种有机污染水体生物修复剂及其制备方法，原料包括以下组分及重量百分比含量：米曲霉菌液0.6～1.0％、蜡样芽孢杆菌菌液0.6～1.0％、土曲霉菌液0.6～1.0％、构巢曲霉菌液0.6～1.0％、谷壳50～60％，余量为天然河水，通过混合、发酵、驯化制备得到有机污染水体生物修复剂。与现有技术相比，本发明使水体中形成黑臭、富营养化得有机污染物得以分解带出水，从而提升了水质，结合其他技术，如水生动植物等，可以使污染水体恢复到地表IV～V类水。