本发明涉及一种含氯代有机污染物废水的处理方法，具体是生产含氟新型冷却剂过程中产生的含氯代有机污染物废水的处理方法；包括有以下步骤：1）向含氯代有机污染物废水中加入萃取剂定制油，萃取分离得到下层液体A；2）将液体A置于无氧环境，加入厌氧污泥混合液，保持温度27～32℃，反应3～5h后得到液体B；3）液体B移出无氧环境，对液体B进行微氧/活性炭消毒处理，得到液体C。4）向液体C中加入好氧污泥混合液，同时向混合液中间歇曝气，反应温度保持在15～25℃，反应4～6h处理结束。物理法和生物法相结合，厌氧、好氧的方法互补，COD的去除率为98%以上。