本发明公开了一株用于高效降解木质素的水稻内生菌Pantoeasp.Sd-1，保藏号为CGMCCNo.6698。本发明水稻内生菌是一株能够在以碱木质素为唯一碳源的培养基上生长的菌株。该菌株在补充了1%葡萄糖和0.5%蛋白胨的含有3g/L碱木质素的液体培养基中，在培养4天后木质素褪色率与降解率分别达到52.38%和69.06%。在补充了1%葡萄糖和0.5%蛋白胨的含有10g/L水稻秸秆的液体培养基中，秸秆降解率最高可达54.51%。