本发明为西瓜品种‘Crimson Sweet’和‘黑孩儿’高效再生体系的建立方法，属于植物生物技术领域。有效控制西瓜不定芽水渍化现象发生的高频再生体系建立方法，该方法步骤为以2个品种5d苗龄成熟胚子叶和下胚轴为材料，在不定芽诱导培养基中获得不定芽，不定芽在芽伸长培养基上培养2-3周后转移至生根培养基，最终获得再生植株。通过调控不定芽诱导、芽伸长和生根培养基中不同激素的浓度，建立了2个品种的高频再生体系，再生率最高分别为83.3%和79.17%，同时每个子叶基端部分外植体诱导不定芽数可达为3-7个。并且以‘Crimson Sweet’材料的再生体系进行了农杆菌介导遗传转化，获得了抗西瓜枯萎病效应蛋白FonSix6的转基因植株。