一种重金属离子废水综合应用处理的方法，设置有微生物处理的第一沉淀池，并且把第一沉淀池和塑料挤出机的冷却槽连通起来。有以下好处：1、采用特制的微生物菌剂即特制EM菌落，并且采用谷壳活性炭和木炭作为菌床，菌床与水体接触面积大，能够有效的吸附重金属离子。2、采用塑料挤出机冷却水的余热，节约了能源的同时能够保持微生物处理始终在适宜的30～40摄氏度环境下活动，最大可能的吸取到水体中的重金属离子。3、水泵不停的把塑料挤出机的冷却水与第一沉淀池内进行冷热水流循环，使得水体中的大分子有机物能够均匀的被漂浮木围栏中的木炭和谷壳活性炭所吸附，提供给特制EM菌落生长繁殖。