本发明公开了一种电絮凝装置的电源极性自动倒向方法，该方法包括步骤：（1）采集第一电极和第二电极之间的电流和电压，并根据采集所得的电流和电压值计算第一电极和第二电极之间的电阻增加值；（2）判断该电阻增加值是否达到设定值，如果该电阻增加值达到设定值，则进入步骤（3），否则返回步骤（1）；（3）控制电源的正负极性倒向，同时将计算所得的电阻增加值清零，返回步骤（1），重新计算倒向后第一电极和第二电极之间的电阻增加值。本发明方法通过检测第一电极和第二电极之间的电阻增加值自动控制电源的正负极性倒向，避免了因水质不同而导致的防钝化效果差的问题，提高了电极防钝化效果，且无需手动调整，减轻工作人员工作量。