本发明公开了一种硬底质富营养化湖泊的生态修复方法，其步骤：1）沉水植物种类的选择；2）种植载体的制作：将竹圈衬在降解无纺布网袋中，网袋中装入环保陶瓷滤球，并用降解纤维带将网袋串联起来；3）种植方法：将沉水植物幼苗移栽到网袋中，然后将串联的网袋沉入湖底；4）沉水植物生长初期通过环保陶瓷滤球吸附底泥和水体中氮、磷等物质，沉水植物生长后，通过沉水植物和陶瓷滤球的联合作用修复富营养化湖泊水体和底泥；5）对沉水植物进行科学管理和养护。本发明应用于硬底质淤泥层较薄的富营养化湖泊的生态修复工程。操作简单易行，成本低廉，沉水植物成活率高，无二次污染，将生态修复技术推广应用到硬底质富营养化湖泊的修复工程中。