本发明公开了一种硫酸钙垢化学清洗剂、制备方法及应用。所述清洗剂包括：络合剂10～30wt％；助溶剂5～10wt％；渗透互溶剂0.1～5wt％；pH调节剂5～13wt％；余量为水。所述制备方法包括：按顺序将络合剂、部分水和助溶剂、渗透互溶剂加入反应釜中，在搅拌状态下用pH调节剂将溶液pH调节到≥10，搅拌，待降温后制得所述硫酸钙垢化学清洗剂。所述硫酸钙垢化学清洗剂与水混合后清除硫酸钙垢。本发明具有快速、高效的特点，一步法完成清洗过程并且不需要加热，在大幅降低操作成本的同时也节约了清洗加热的能耗。可用于各种管线、水处理滤膜、流量计等精细仪表和油田井下工具、管线的硫酸钙垢清除作业。