一种连续电除盐装置的清洗方法，属于锅炉补给水处理技术领域，它包括系统冲洗、氯化钠溶液冲洗、氯化钠/氢氧化钠混合溶液循环清洗和还原备用四个流程。本发明具有下述特点：1、使用高PH清洗液去除CEDI膜堆内的有机和生物污染物；2、在高pH清洗液循环前用中性的NaCl溶液冲洗以去除树脂中的硬度离子，防止其在高PH清洗中形成沉淀；3、避免了过去使用低PH的清洗剂去除硬度离子时造成的有机和生物污染物的硬化；4、使用5％氯化钠/2％氢氧化钠混合液对CEDI系统进行清洗，操作简单，对于去除有机和生物污染物效果好。