本发明公开了一种淀粉基二氧化硅复合微球及其制备方法，包括以下步骤：（1）将10mg～150mg的淀粉溶解于5mL～50mL良溶剂，加热搅拌，在搅拌条件下，滴加5mL～20mL不良溶剂，搅拌，形成均匀溶液；（2）在均匀溶液中加入催化剂，调节pH为酸性或碱性，滴加100μL～500μL的硅源，水解，陈化，离心，去上清，得到白色沉淀；（3）将白色沉淀用蒸馏水和无水乙醇交替洗涤，干燥，即得到淀粉基二氧化硅复合微球。本发明实施简单、绿色环保、制备的淀粉基SiO₂复合微球的粒径分布均一，粒径在亚微米级，且具有较高的机械强度和较高的热稳定性，能大大提高吸附效率，水中金属离子的最大吸附量达到90%以上。