本发明公开了一种磁性金纳米粒子复合材料及其制备方法和应用，合成四氧化三铁的磁性微球，然后加入四乙氧基硅在磁性微球表面水解聚合，再加入N-(2-氨乙基)-3-氨丙基三甲氧基硅烷以得到表面修饰双氨基基团的Fe₃O₄/SiO₂磁性微球，最后表面修饰双氨基基团磁性微球与金纳米粒子实施复合。本发明技术方案利用双氨基的螯合作用更牢固的吸附金纳米粒子，而且该材料结合了金纳米粒子的表面选择性和磁性纳米粒子的超顺磁性，能够萃取水中苯并芘，并且可进行快速、高效分离。