本发明提供一种12-羟基硬脂酸的生产废水处理方法，首先对酸解工序废水进行酸处理、碱处理、蒸发提取出甘油水和硫酸钠盐，甘油水再进行蒸馏、脱色、过滤制得甘油，蒸发出的冷凝液作为工艺水循环使用；然后对洗涤工序产生的废水和第一部分处理后剩余废水进行中和、厌氧、兼氧、好氧、过滤、MBR膜法处理，确保水质实现循环回用和达标排放。该种12-羟基硬脂酸的生产废水处理方法和现有技术相比，整体自动化程度高、生产效率高、员工劳动强度小、所需劳动力数量少、节能效果显著，有效处理12-羟基硬脂酸生产过程中产生的废水，降低生产成本，增强产品竞争力的同时，确保了废水达标排放，有效的防治污染，保护生态环境。