本发明提供了一种养殖池塘水体微型生物群落调控用碳源及其应用，按重量份数计算配方包括：可溶性淀粉60-100份，植物蛋白5-20份，小分子有机酸钠盐5-20份。实验证明，本发明的复配碳源可降低池塘水体氨氮浓度、提高藻类丰度，控制气单胞菌数量，因此，在调控养殖池塘水体微型生物群落方面有很大的应用潜力。