本发明公开了一种利用超滤膜深度处理废纸制浆造纸综合废水的方法。采用方法要点是将废纸制浆造纸废水二级处理工段出水通入间歇板式膜过滤器，通过超滤膜分离过程，最终分别得到废纸制浆造纸综合废水膜分离深度处理的浓缩液和透过液，透过液可直接回用废纸制浆造纸工段或达标外排。该种方法快速、高效，不产生二次污染，特别适用于废纸制浆造纸综合废水的深度处理过程。本发明将废纸制浆造纸综合废水的二级处理工段出水进行了超滤膜深度处理，进一步提高了废水的净化效率，实现了废纸制浆造纸综合废水绝大部分循环回用，减少了生产过程清水消耗，降低了外排废水污染负荷，具有重要的实际生产意义。