本发明公开一种酱油酿造工业废水的处理方法及处理系统，包括有调节池、厌氧生化池、缺氧生化池、好氧MBR池、用于加入聚合氯化铝以进一步去除COD和色度的混凝沉淀池/气浮池以及用于加入次氯酸钠浓液以进行氧化脱色和进一步去除COD的氧化脱色池；藉此，使得酱油酿造工业废水依次经过调节池、厌氧生化池、缺氧生化池、好氧MBR池、混凝沉淀池/气浮池以及氧化脱色池作相应的处理后排放，能够将酱油酿造工业废水进行有效处理并稳定达到《污水综合排放标准GB8978-1996》一级标准和《广东省水污染物排放限值（DB4426-2001）》的要求，且，本处理系统具有占地面积小、工程改造投资费用小、工艺操作简单、运行成本低等优点。