本发明公开了一种水体淤泥原位净化干粉制剂，属环境污染治理领域。本发明将微生物菌粉和酶制剂复配，并附着载体形成干粉制剂，所述微生物菌粉是指先将不同种类的微生物菌种单独分级培养，然后将发酵液混合并冷冻干燥，制成微生物菌粉；所述酶制剂为纤维素酶、中性蛋白酶、低温淀粉酶、脂肪酶的混合物；所述载体为沸石、高岭土和硅藻土的混合物。将干粉制剂投入到污染水体中，不仅可以降解河道中的淤泥，而且可以降低水体中有机物质的含量，同时可以节省大量的人力、物力及财力，操作简单方便，不用定期进行清淤工作，可适用各类污染水体，适用面广，清淤效果明显，是一种高效，清洁，无污染，安全环保的水环境净化和淤泥分解剂。