本发明公开了一种利用生物丁醇的工业废水废气生产微藻的方法及其应用。该方法将废水废气的处理与微藻培养结合起来，利用生物丁醇的工业废水废气配制藻液培养基生产微藻，充分利用了生物丁醇的工业废水废气及其残留的营养成分，所要添加的营养元素含量较低，成本低，在培养微藻的同时实现对废水废气的处理，实现了资源的有效利用和污染的零排放，防止了环境污染。本发明提供的利用生物丁醇的工业废水废气生产微藻的方法可应用于工业化生产微藻，得到的微藻可以用于制备藻蛋白饲料、虾青素、类胡萝卜素或叶黄素等高附价值的产品，具有良好的经济效益。