本发明公开了一种含氮磷污水同步脱氮除磷的方法，属于污水处理领域。其步骤为：（1）筛选脱氮硫杆菌：从厌氧活性污泥中筛选利用硫化亚铁中的硫源进行自养反硝化的脱氮硫杆菌作为目标菌种；（2）反应器填料准备：将粒径＜25mm的硫化亚铁直接置于反应容器中；（3）加入污水：向反应容器通入待处理污水，该待处理污水是pH值为5.0~9.0的含氮磷污水；（4）自养反硝化过程：反应容器在厌氧条件下，在10~40℃温度下混合反应2-~6d，脱氮硫杆菌在将硫化亚铁氧化的同时将水中的NO₂^－和NO₃^－还原为N₂，同时利用氧化产物铁离子沉淀水中的磷；（5）固液分离。本发明实现了脱氮硫杆菌脱氮技术和铁离子除磷技术的自然融合，反应成本低，处理效果好。