一种有机废弃物的源头分离治理系统及方法，具体涉及一种节约水资源及有机废弃物的减量化、资源化利用的环保处理技术。源头分离治理系统，由有机废弃物源头分离系统、输送系统、自动装袋系统、处理系统组成。在厨房为居民提供便利的厨余垃圾输送管道，使厨余垃圾不出厨房即可输送外运，同时避免了厨余垃圾跟其他生活垃圾相互混合污染，使其它可回收物质可最大化的得到回收利用；在厕所中安装节水马桶等卫生设施，在节水、节能的同时使粪尿的输送跟其它洗涤用水分开排放，使洗涤用水（灰水）跟黑水（粪尿）分离并分别输送，灰水经过简单的处理即可成为中水实现销售，而黑水及固体有机废弃物经有机废弃物处理系统处理后得到资源化利用。