一种膜生物反应器短程硝化工艺的快速启动方法属于城市污水处理与资源化领域。在膜生物反应器（MBR）内启动短程硝化工艺，其步骤为：首先接种城市污水厂回流污泥，在供养充足的条件下恢复污泥活性；其次在限氧条件下，保持进水流量不变，逐渐增加氨氮浓度从而增大进水氨氮负荷，成功启动短程硝化；最后在相同的运行条件下，调节HRT为6.2~7.5h，成功启动部分短程硝化。本发明提供了一种在MBR反应器中快速启动短程硝化的策略，为MBR反应器应用于短程硝化的长期高效稳定运行提供了方法。