本发明公开了一种改性海藻酸钠絮凝剂的合成方法及其应用，通过用部分氧化的海藻酸钠与具有功能基团的螯合剂氨基硫脲在水溶液中进行反应，得到可生物降解的天然高分子絮凝剂。本方法主要有两个反应过程：(1)用高碘酸钠氧化海藻酸钠，制备具有二醛结构的部分氧化的海藻酸钠，氧化度为68.2％；(2)取氧化的海藻酸钠溶于磷酸缓冲液(pH＝7.0)配成均匀溶液，加入氨基硫脲反应4h生成希夫碱，然后加入NaBH₄生成稳定的胺。本发明工艺简单易控，原材料易得，成本低，易于推广应用。经化学改性的海藻酸钠引入了氮、硫元素，大大提高了海藻酸钠絮凝剂对污水中重金属离子的吸附容量及去除率。本絮凝剂可生物降解，不造成二次污染物的产生。