本发明公开了一种用于废水中重金属深度去除的复合药剂及其制备方法，按重量份计，由以下原料制成：成分A：改性凹凸棒土粉末20-30份；改性天然高分子聚合物30-50份；表面活性剂0-3份；成分B：无机絮凝剂，所述成分A与成分B的重量比为2.5-8.3：1。本发明对水中重金属离子具有很强的吸附、螯合和絮凝性能，同时可以辅助降低COD、脱色、除磷等多种功效，且处理效果好，制备方法简单易。