本发明提供了一种缺氧生物反应器，分为强流化区、弱流化区、泥水分离区三个部分；强流化区与弱流化区共用一个下部外筒体，强流化区位于反应器下部，强流化区通过强流化区带孔塔板与弱流化区相连；弱流化区位于反应器中部，包括隔板、喷嘴、弱流化区导流筒和弱流化区带孔塔板，隔板中心开孔，喷嘴呈喇叭状，喷嘴底部通过隔板中心的开孔与隔板相连接，喷嘴顶部伸入弱流化区导流筒底平面至导流筒中部的区域，弱流化区带孔塔板位于弱流化区顶部，隔板、喷嘴、弱流化区导流筒和弱流化区带孔塔板自下而上位于同一轴线上；泥水分离区位于反应器顶部。本发明能有效降低导流筒高度，降低流化能耗，有利于设备的工业化。