一种促使连续流污水处理系统快速实现短程硝化的连续流运行方法，属于生化法污水处理领域。本发明利用亚硝酸盐氧化菌活性在缺氧条件受到抑制、在好氧条件下恢复缓慢的特性，将连续流系统改造成四段缺氧、好氧交替运行的方式，逐步提高亚硝酸盐积累率；并通过排泥的方式淘洗出系统内的亚硝酸盐氧化菌，最终实现稳定的短程硝化效果。实践证明，在系统启动后1个污泥龄左右其亚硝酸盐积累率即能达到80%以上。本发明与依靠降低溶解氧实现连续流系统中短程硝化的方法相比，具有实现周期短、短程效果更稳定、硝化速率高及不容易引发污泥膨胀等优点，可作为一种专门针对连续流系统的短程硝化快速启动方法，适用于各种规模的连续流污水处理系统。