本发明涉及一种加氢过程中所生成的含硫、含氮废水、废气的联合处理系统及方法。处理系统，由吸收单元、解吸单元和冷凝单元构成；将废气中的NH₃和H₂S转移到水相中，得到净化的燃气，水相与含硫、含氮废水性质相似，所以将二者合并处理，经过单塔或双塔气提，得到达标废水、H₂S和氨，H₂S可进一步制为硫磺，NH₃用于制备液氨或氨水，硫磺、液氨或氨水作为产品，彻底实现硫化氢和氨的治理。该工艺设备简单，能联合处理含H₂S和NH₃的废气和废水，脱除并回收H₂S和NH₃，得到清洁燃气和达标废水，实现了资源综合利用，绿色环保。