本发明提供了一种复合水处理剂及其制备方法与应用。其中，本发明的复合水处理剂包含48～70重量份钠基膨润土、8～15重量份硅藻土、8～15重量份沸石、6～10重量份磁性物质、5～7重量份壳聚糖以及3～5重量份聚丙烯酰胺的各组分，该复合水处理剂的制备方法简单，材料来源广泛。复合水处理剂能够去除水中的重金属离子和有机污染物的同时，还能起到降低水中电解质浓度，此外，还能借助于磁滤法进行快速地固液分离的作用。本发明可应用于反渗透系统的预处理工艺，有助于提高反渗透系统的产水率，降低反渗透系统的工作压力，有显著的实用价值和广阔的市场前景。