本发明公开了一种水用消毒系统，属于对水消毒处理领域。该系统包括：进水管、消毒壳体、纳米消毒管和出水管；其中，所述进水管依次与所述消毒壳体和出水管连通；所述纳米消毒管设置在所述消毒壳体内，所述纳米消毒管内填充有纳米铁铝合金多孔材料。该系统通过在消毒壳体内设置的纳米消毒管内填充纳米铁铝合金多孔材料，通过纳米铁铝合金多孔材料的吸收、吸附和过滤作用，以及铁铝在水中发生水解反应，形成絮状Al（OH）3和Fe（OH）3沉淀，对通过纳米消毒管内的水中细菌微生物等杂质起到良好的絮凝沉淀作用，去除水中的细菌微生物，且不会产生致癌、致畸、致突变的二次污染物，从而实现了真正意义上的安全消毒。