本发明公开了一种底栖软体动物和水生植物联合去除水体重金属铜的方法，包括以下步骤：（1）选择受径流铜污染的水体；（2）选择适合的底栖软体动物；（3）投放软体动物；（4）选择适合的水生植物；（5）种植水生植物；（6）定期监测雨后水体和水生植物体的铜含量；（7）收割水生植物。通过底栖软体动物和水生植物联合作用，使颗粒态铜迅速沉降，减小其扩散范围，实现水生植物原位修复，其优点是操作简单易行，成本低廉，安全无二次污染，可在针对受径流铜污染的水体生态修复中加以使用。