本发明公开了一种新型环保微生物水质净化混合剂及其制备方法。该微生物水质净化混合剂主要是由高浓度枯草芽孢杆菌液与高浓度噬菌蛭弧菌液组成的混合微生物菌剂：它由下述体积百分比的原料配制而成：枯草芽孢杆菌液10％-50％；噬菌蛭弧菌液20％-60％；生理盐水0.5％-6.0％；微量元素溶液0.5％-15％。本发明的新型环保微生物水质净化混合剂，其将枯草芽孢杆菌净化水质和噬菌蛭弧菌防治疾病的优势集合于一体，同时具备净化水质和防病治病及取代抗生素的功能，并起到改良水产养殖水体的作用。