本发明公开了一种高浓度叔丁醇废水的生化处理工艺，将叔丁醇废水稀释后引入兼氧池，加入营养剂，停留时间1～10天进行兼氧处理；将兼氧池处理后的叔丁醇废水引入EGSB厌氧塔，一次性加入营养剂，停留1～12天进行厌氧处理；将EGSB厌氧塔处理后的叔丁醇废水引入A/O池，一次性加入营养剂，停留时间1～8天，与A/O池污泥接触进行耗氧生化处理；将处理后的叔丁醇废水排入二沉池分去污泥，通过该艺将可生化性很差的高浓度叔丁醇废水（COD值为20000～25000mg/L），经本发明的生化处理工艺处理后，出水COD值达到100mg/L以下。