本发明属于环境污染生物修复领域，公开了一种降解除草剂氰氟草酯的细菌及其应用。一种降解除草剂氰氟草酯的细菌Aquamicrobium lusatiense JW-1，保藏于中国典型培养物保藏中心，菌种保藏号为CCTCC NO：M 2012297，保藏日期为2012年7月20日。由该细菌制备的菌剂对氰氟草酯降解效率高达到95％以上，降解速度快，消除农产品中除草剂氰氟草酯残留，可用于降解土壤和水体中除草剂氰氟草酯残留，解决除草剂氰氟草酯对对土壤水体环境的危害问题。