本发明提供了一种用于富营养化污染水体修复的浮岛系统及水体修复方法，所述浮岛系统包括漂浮在水面上的基体、设置在基体上的微纳米气泡发生装置和设置在基体上的控制装置以及基体上的植物无土种植装置；所述微纳米气泡发生装置所产生的气泡的直径为1至50μm。本发明的浮岛系统操作使用方便，将多种处理方式有机结合，并且本发明的增氧方式不会破坏自然水体的温度跃层，不会改变整个水域的生态环境。