本发明公开了一种多功能膜曝气人工湿地污水处理系统，包括人工湿地池，在人工湿地池底部有防渗处理层，防渗处理层上方依次铺设卵石垫层、陶粒滤料层和种植土层；在人工湿地池两侧分别设置有配水区和集水区，配水区和集水区与人工湿地池之间由穿孔花墙相连接，可针对污水的进水水质进行变换的多功能人工湿地污水处理。其曝气方式灵活、运行形式灵活、处理效果佳、且节约能源。具备传统人工湿地的功能，又具有曝气型人工湿地的功能，同时可以以膜生物反应工艺、生物接触氧化形式进行多功能的运行。