一株硫氧化细菌及用其去除硫化物的方法，属于生物和环境保护技术领域。本发明公开了一株硫氧化细菌，分类命名为嗜热硫杆菌(Themithiobacillus tepidarius )JNU-2，保藏编号为：CCTCC NO：M2013217。该菌对硫化合物的氧化效率很高而且高效的产生高附加值的副产物单质硫。本发明还涉及一种将该菌株应用于气升式内循环连续操作好氧反应装置去除含硫废液中硫化物的方法，在该反应器中应用JNU-2进行硫化合物去除，在水力停留时间（HRT）为10h时，单质硫产率为0.15g L^-1h^-1，单质硫生成率为60%左右，硫代硫酸盐氧化率98%以上。本发明的气升式内循环连续操作好氧反应装置表现良好，有望应用于大规模生产含硫废液中硫化物的去除。