本发明公开了一种垂直折流复合厌氧消化器，包括外筒，所述的外筒内部中心位置设置有中心回流筒，所述的中心回流筒的底部为锥形结构；所述的中心回流筒的外壁与外筒的内壁之间的空间形成污泥床区；所述的外筒的底部设置有管孔式布料装置，所述的管孔式布料装置与底部的进料管连接，所述的进料管与一双向调控机构连接，所述的双向调控机构的控制端连接于控制器；所述的外筒的中上部设置有三相分离器，所述的三相分离器（含填料区）的上方设置有溢流槽，所述的溢流槽上方设置有集气室，所述的集气室的上端设置有沼气管，所述的溢流槽的一端设置有出料口，所述的出料口通过溢流管与外部的具有水密封结构的U型管连接。