本发明公开了一种基于MBBR的厌氧氨氧化工艺预处理方法，属于污水处理领域，其解决了现有技术在短程硝化工艺中存在的启动困难、亚硝化率不稳定、出水氨氮和亚硝酸盐氮的比值不能达到厌氧氨氧化工艺要求等问题。本发明方法包括接种启动、MBBR短程硝化启动、MBBR短程硝化连续流运行与控制，氨氮氧化膜面负荷可达到1.5gN/m²/d以上，氨氮氧化率在50-60%，亚硝酸盐积累率≥90%，反应器出水氨氮与亚硝酸盐氮比值在1.0-1.3，满足厌氧氨氧化工艺进水水质要求。本发明的短程硝化效果稳定；氨氮氧化负荷高，操作简单，运行可靠；相比传统工艺，氧利用率高，曝气流化能耗低。